Precision Medicine will need to get out of the pharma silo that is based on symptoms


Welcome to the digital era of biology (and to this modest blog I started in early 2005).

To cure many diseases, like cancer or cystic fibrosis, we will need to target genes (mutations, for ex.), not organs! I am convinced that the future of replacement medicine (organ transplant) is genomics (the science of the human genome). In 10 years we will be replacing (modifying) genes; not organs!


Anticipating the $100 genome era and the P4™ medicine revolution. P4 Medicine (Predictive, Personalized, Preventive, & Participatory): Catalyzing a Revolution from Reactive to Proactive Medicine.


After low-cost airlines (Ryanair, Easyjet ...) comes "low-cost" participatory medicine. Some of my readers have recently christened this long-lasting, clumsy attempt at e-writing of mine "THE LOW-COSTE INNOVATION BLOG". I am an
early adopter of scientific MOOCs. My name's Catherine Coste. I've earned myself four MIT digital diplomas: 7.00x, 7.28x1, 7.28.x2 and 7QBWx. Instructor of 7.00x: Eric Lander PhD.

Upcoming books: Doomsdare, a medical thriller (action taking place in Beijing) Fall 2016; Jesus CRISPR Superstar, a sci-fi -- French title: La Passion du CRISPR (2017). Special thanks to Prof. Emmanuel Lincot, lawyer David Kilgour and Isabelle Provost for their help.

I love Genomics. Would you rather donate your data, or... your vital organs?

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Concernant les fichiers son ou audio (audio files) sur ce blog : ce sont des fichiers Windows ; pour les lire sur Mac, il faut les ouvrir avec VLC (http://www.videolan.org).


$1k human #genome? OK, now what?

Now what? Connecting the dots between genotype and phenotype...
"The HiSeq X Ten should give us the ability to analyze complete genomic information from huge sample populations,' said Eric Lander, founding director of the Broad Institute and one of the world’s leading geneticists, in a statement. 'Over the next few years, we have an opportunity to learn as much about the genetics of human disease as we have learned in the history of medicine.'"
The race for the $1,000 genome has been won.

"Illumina’s supercomputing machine, which is a combination of ten machines working together and is called the HiSeq X Ten, is available to purchase at a starting price of $10 million. This is too expensive for most labs, but three of these machines have been acquired by Macrogen, The Harvard-MIT Broad Institute in Cambridge, and the Garvan Institute of Medical Research in Australia."
Venturebeat.com January 17, 2014
 ... and don't forget the NY Genome Center!
Un coût divisé par 100.000 :

"La raison d'une telle avancée ? Depuis les années 2005, le séquençage a fait un bond. Une rupture s'est produite. 'Le décryptage s'effectue de façon massivement parallèle sur des puces. Roche, puis Illumina et Life Technologies ont été les pionniers de ces nouvelles méthodes', rappelle le directeur adjoint de l'Institut de génomique. Des brins d'un génome, cassé en morceaux de 100 à 150 bases, se collent sur la puce, où sont fixées des amorces, puis sont lues par une caméra. La performance s'améliore quand la densité de la puce et la vitesse de la lecture optique augmentent. Puis les brins sont assemblés et reconstitués en 23 chromosomes, par calcul informatique, 'par comparaison au génome humain de référence, dont la connaissance s'est nettement affinée depuis le premier génome complet publié en 2003', ajoute Pierre Le Ber. Des années 1970 jusqu'en 2005, la technique enzymatique sélective, élaborée par le Britannique Frederick Sanger, double prix Nobel de chimie, était moins rapide.
'Pour la recherche, c'est, bien sûr, très intéressant. Mais une telle performance est encore plus essentielle pour la génomique clinique afin, par exemple, d'identifier la nature des altérations génétiques qui seraient à l'origine d'un cancer donné, en décryptant l'ADN du malade et celui de sa tumeur. Ce qui peut aider, dans certains cas, le médecin à mieux cibler le traitement', précise le directeur adjoint de l'Institut de génomique."
Le Figaro Sciences - 21 Janvier 2014




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